Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MLH3Q9UHC1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MLH3Q9UHC1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MLH3Q9UHC1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms