Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPARGC1AQ9UBK2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms