Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb1Q9QXJ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms