Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim44Q9QXA7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim44Q9QXA7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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