Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cln8Q9QUK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms