Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC28Q9NX36 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DNAJC28Q9NX36 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms