Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OPA3Q9H6K4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OPA3Q9H6K4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms