Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF3Q9H094 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms