Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fundc2Q9D6K8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fundc2Q9D6K8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms