Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Odf2lQ9D478 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Odf2lQ9D478 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms