Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms