Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gkn2Q9CQS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn2Q9CQS6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms