Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim26Q99PN3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms