Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ddb2Q99J79 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms