Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX2Q99811 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRX2Q99811 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX2Q99811 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms