Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS6Q96GS4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS6Q96GS4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms