Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC11Q96DB2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms