Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCE1Q969G3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCE1Q969G3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms