Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpe65Q91ZQ5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms