Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOBEC4Q8WW27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC4Q8WW27 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms