Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc9Q8VC31 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms