Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TTLL11Q8NHH1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTLL11Q8NHH1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTLL11Q8NHH1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms