Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BEST2Q8NFU1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BEST2Q8NFU1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms