Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF39Q86UA1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF39Q86UA1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms