Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L3Q6VB84 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXD4L3Q6VB84 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms