Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRNIPQ6NTE8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRNIPQ6NTE8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms