Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 YPR136CYPR136C 513 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 UBS1YBR165W 834 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 MRPL27YBR282W 441 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 ECM18YDR125C 1362 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 BCS1YDR375C 1371 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 HFD1YMR110C 1599 nt3.08□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 HDA2YDR295C 2025 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 AKR1YDR264C 2295 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RPS14AYCR031C 414 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDR340WYDR340W 303 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RRP17YDR412W 708 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 LST7YGR057C 729 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 MAK16YAL025C 921 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 ARC19YKL013C 516 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YKL162CYKL162C 1209 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SAS5YOR213C 747 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YOR238WYOR238W 912 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 PCI8YIL071C 1335 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RPN1YHR027C 2982 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 TFB2YPL122C 1542 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDL180WYDL180W 1644 nt3.07□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YMR317WYMR317W 3423 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 TSC13YDL015C 933 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RPS29BYDL061C 171 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 LRG1YDL240W 3054 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDL242WYDL242W 354 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 KXD1YGL079W 657 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 TAM41YGR046W 1158 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 DOG2YHR043C 741 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YJR111CYJR111C 852 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 GAB1YLR459W 1185 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 ATG29YPL166W 642 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 MRP2YPR166C 348 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 MAK21YDR060W 3078 nt3.06□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SIN4YNL236W 2925 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 EBS1YDR206W 2655 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YGL138CYGL138C 1038 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 CFD1YIL003W 882 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YVH1YIR026C 1095 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 GTT1YIR038C 705 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 ERP1YAR002C-A 660 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RIF2YLR453C 1188 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 DUG3YNL191W 1074 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 HUB1YNR032C-A 222 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 TRM112YNR046W 408 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 NIP7YPL211W 546 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDL199CYDL199C 2064 nt3.05□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SPO14YKR031C 5052 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 VPS33YLR396C 2076 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDR124WYDR124W 975 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 PEX10YDR265W 1014 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 PMI40YER003C 1290 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 LSM12YHR121W 564 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 AIM26YKL037W 357 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 OST6YML019W 999 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YML090WYML090W 387 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YBL065WYBL065W 345 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YPR078CYPR078C 1119 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RRP7YCL031C 894 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SPO71YDR104C 3738 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 IOC3YFR013W 2364 nt3.04□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 MIP6YHR015W 1980 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 BCH1YMR237W 2175 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 PTI1YGR156W 1278 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 EPT1YHR123W 1176 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 ARG3YJL088W 1017 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YLR290CYLR290C 834 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 GLO1YML004C 981 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 TFB6YOR352W 1032 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 FIG1YBR040W 897 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 RCY1YJL204C 2523 nt3.03□□□□□ -1.92
RPN6Q12377 YDR089WYDR089W 2610 nt3.03□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 ENA5YDR038C 3276 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 FAS1YKL182W 6156 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 ROM1YGR070W 3468 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 MET10YFR030W 3108 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 NOP4YPL043W 2058 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 ALG8YOR067C 1734 nt3.02□□□□□ -1.93
RPN6Q12377 CDC40YDR364C 1368 nt3.02□□□□□ -1.93
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