Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF543Q08ER8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF543Q08ER8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms