Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn2Q08093 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms