Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR3Q06889 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms