Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC5P78333 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC5P78333 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC5P78333 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC5P78333 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms