Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NficP70255 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NficP70255 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NficP70255 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NficP70255 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NficP70255 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NficP70255 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NficP70255 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NficP70255 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NficP70255 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms