Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia3P60469 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia3P60469 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms