Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIA4P48058 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms