Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms