Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 LRRC42-202ENST00000371368 838 ntTSL 319.12■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-205ENST00000519876 585 ntTSL 318.87■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-204ENST00000578130 853 ntTSL 218.85■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-230ENST00000531831 552 ntTSL 218.66■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-223ENST00000585299 537 ntTSL 418.55■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC22A20-203ENST00000529062 1939 ntTSL 518.49■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-215ENST00000582574 556 ntTSL 318.35■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FBXL18-202ENST00000415009 2526 ntTSL 218.35■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.476e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-229ENST00000531703 492 ntTSL 417.98■□□□□ 0.476e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TUBGCP6-203ENST00000434349 830 ntTSL 517.9■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ACTR3-204ENST00000446821 818 ntTSL 317.83■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 LMNB2-203ENST00000490554 689 ntTSL 217.82■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-207ENST00000579481 564 ntTSL 217.79■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-221ENST00000585062 556 ntTSL 417.77■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-202ENST00000547219 611 ntTSL 517.55■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-207ENST00000550169 570 ntTSL 317.55■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 217.51■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-211ENST00000461564 2751 ntTSL 217.4■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 517.25■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-206ENST00000519339 1815 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.21■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-219ENST00000477533 348 ntTSL 416.89■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-210ENST00000527606 569 ntTSL 416.83■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.256e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 216.38■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-221ENST00000485346 557 ntTSL 416.3■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DENND4B-202ENST00000368646 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.21■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADGRD1-204ENST00000446583 5529 ntTSL 515.75■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ACTR3-203ENST00000443297 566 ntTSL 415.36■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADAM15-220ENST00000480331 1016 ntTSL 515.04■□□□□ -06e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DEAF1-205ENST00000526790 498 ntTSL 214.84□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 314.67□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-204ENST00000548154 597 ntTSL 214.5□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-213ENST00000522100 877 ntTSL 314.48□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-210ENST00000550937 781 ntTSL 514.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-203ENST00000547414 521 ntTSL 514.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DEAF1-204ENST00000525904 797 ntTSL 314.17□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 514.17□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-208ENST00000550316 545 ntTSL 514.02□□□□□ -0.176e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-205ENST00000549092 584 ntTSL 414.02□□□□□ -0.176e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 313.72□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 313.57□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-211ENST00000553641 800 ntTSL 312.91□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ACTR3-202ENST00000415792 676 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 GLI4-206ENST00000520021 361 ntTSL 312.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-210ENST00000622804 1976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ADGRD1-213ENST00000543617 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-201ENST00000392708 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RUSC1-AS1-201ENST00000443642 679 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-217ENST00000554910 577 ntTSL 410.58□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 SLC12A9-207ENST00000461016 262 ntTSL 510.44□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-204ENST00000525652 607 ntTSL 29.31□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-220ENST00000556032 643 ntTSL 58.49□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 PRMT5-223ENST00000556616 571 ntTSL 48.42□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.286e-8■■■■■ 32.5
GTF2F1P35269 RABGAP1L-212ENST00000469553 2103 ntTSL 1 (best)6.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 130.4 ms