Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA10P31260 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA10P31260 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA10P31260 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms