Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DOBP13765 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DOBP13765 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms