Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCF2P10911 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCF2P10911 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCF2P10911 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCF2P10911 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCF2P10911 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCF2P10911 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCF2P10911 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms