Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms