Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRGAP2BP0DMP2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRGAP2BP0DMP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRGAP2BP0DMP2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms