Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01822 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01822 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01822 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01822 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01822 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
P01822 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01822 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P01822 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01822 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01822 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01822 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01822 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms