Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRUB2O95900 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRUB2O95900 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms