Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK2O60296 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms