Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYNGR3O43761 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms