Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NudcO35685 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NudcO35685 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NudcO35685 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NudcO35685 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NudcO35685 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NudcO35685 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms