Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema6aO35464 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms