Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Kpna4O35343 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Kpna4O35343 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kpna4O35343 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kpna4O35343 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms