Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Barx2O08686 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Barx2O08686 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Barx2O08686 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Barx2O08686 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Barx2O08686 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Barx2O08686 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Barx2O08686 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Barx2O08686 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms