Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3685J3QPP2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3685J3QPP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms